清真菜是随着伊斯兰教的传入盛行起来的。在伊斯兰教传入之前，我国西北地区的一些少数民族如羌族、维吾尔族等，已擅长做牛羊菜。伊斯兰教最早由阿拉伯人(大食国)于隋代开始传入中国，阿拉伯人于隋唐期间大批从海路和陆路来到中国东南沿海和西北地区。元代又有大批阿拉伯人东来，大量入籍中国，逐渐形成一个回族，回族全部信奉伊斯兰教，所以清真菜又称回回菜，其实中国人信奉伊斯兰教的还有维吾尔族、东乡族和一些汉族人等，称回回菜只是表述了这一菜系的主流。回民散居于全国许多城镇，大多经营饮食业，清真系以牛羊为主，伊斯兰教禁食猪、狗、马、驴、骡和无鳞鱼。南方的清真食店菜目中，鸡、鸭、鹅的比重很大，鸡、鸭、鹅菜的做法，多受南方各菜系的影响。清真系继承了中国古代西北和东北游牧民族做菜的优良传统，名馔有全羊席和烤全羊。其他菜式如涮羊肉、烤羊肉(羊肉片调好味，围着火炉现烤现吃)、烤羊肉串、油爆或水爆肚仁、散丹(牛或羊百叶)、羊肉抓饭等等，都是这一菜系的著名美食。清真系的小吃和糕点也很有名，北方清真饮食店的羊肉水饺、羊肉泡馍、牛(羊)杂汤和黄米豆沙软糕、黄米枣糕等，都很有特色。南方清真饮食店的糕点，以萨其马、蛋馓、蛋糕、核桃酥等著名，其他糕点则多仿制南方各菜系。

(3)食疗菜系

食疗菜系又称“药膳”，是以各类中药与一定的肉类配伍制成的菜肴或汤类，尤以炖品为多，如淮山、杞子炖乳鸽或炖竹丝鸡、炖鹧鸪等(补虚弱)、天麻炖鱼头(补脑)、当归、首乌炖鸡蛋(补血安神)、黄芪、党参炖鹿筋或狗肉、牛鞭等(补气壮阳)、田七炖鸡脚或猪脚(跌打补剂)、茯苓熬龟(去湿毒)、哈士玛油、银耳炖鹌鹑(润肺安眠)、黄芪、淮山炖三蛇(补血气，去风湿)等等。

食疗菜在封建帝王的御膳房中，一直有专职厨师掌理。在民间则包含在各菜系中。专门的食疗饭馆，过去只是稀疏出现，主要是近年发展起来的。随着预防医学的发展和人们对饮食保健的重视，近年食疗菜系的推出，在中国的饮食文化中已崭露头角，日益为世界各地所瞩目，仅东京近年就有近30家药膳馆开业。